Я бы рекомендовал использовать модули es6 вместо обычной версии Babylon.
Документацию можно найти здесь:
https://doc.babylonjs.com/features/es6_support
Все пакеты находятся под@babylonjs (например, core - https://www.npmjs.com/package/@babylonjs/core), и он поддерживает тряску деревьев и другие полезности.
Если вы хотите использовать версию requirejs / amd, вам нужно будет использовать пакет babylonjs, но из вашего другого вопроса мне кажется, что вы пытаетесь использовать модули es6 (импортируйте вместо require), так что это было бы лучшим решением для вас.