Перейдите в корневую папку вашего Functionapp, где находится ваш functionApp.csproj, и выполните приведенную ниже команду
dotnet build /p:DeployOnBuild=true /p:DeployTarget=Package;CreatePackageOnPublish=true
. Это позволит опубликовать папки и файлы, готовые для архивирования, в папке bin/Publish. ,Теперь вы можете использовать командлет Compress-Archive powershell для архивирования папки или любым другим способом, который вы предпочитаете.