markerline, stemline, baseline, = ax.stem(x,y,linefmt='k-',markerfmt='ko',basefmt='k.')
plt.setp(stemline, linewidth = 1.25)
plt.setp(markerline, markersize = 5)
В то время как первые две строки кода взяты из ссылки в моем вопросе, третья строка кода изменяет размер маркера.