Файл pydicom обнаружил ошибку при использовании pydicom.dcmread (путь + '/' + s) для s в os.listdir (путь) - PullRequest
Новая
       44

Файл pydicom обнаружил ошибку при использовании pydicom.dcmread (путь + '/' + s) для s в os.listdir (путь)

0 голосов
/ 14 апреля 2020

Я начинаю использовать пакет pydicom. Я следую инструкциям здесь https://medium.com/@hengloose / всеобъемлющее руководство для начинающих по визуализации и анализу dicom-images-in- python -7a8430fcb7ed Но я не могу понять, почему я всегда получайте FileNotFoundError: [Errno 2] Нет такого файла или каталога:

когда дело доходит до этой строки 

pydicom.dcmread(path + '/' + s) for s in os.listdir(path)

Я использую Ubuntu bash на windows 10 и когда Я использую команду ls, файл dicom не отображается, хотя я вижу его в обычном браузере.

Используемый файл загружается отсюда https://www.theobjects.com/dragonfly/learn-sample-datasets.html

спасибо за вашу помощь

обновление:

Я замечаю, что если я пытаюсь получить другой файл dicom в каталоге Ubuntu, он не найден в Ubuntu bash, но он все еще находится в windows (как с браузером, так и в cmd)

вывод dir в cdm windows

04/14/2020  09:50 PM    <DIR>          .
04/14/2020  09:50 PM    <DIR>          ..
04/11/2020  11:56 AM    <DIR>          .git
04/11/2020  11:56 AM             1,305 .gitignore
04/11/2020  11:56 AM             1,366 COPYRIGHT.md
04/14/2020  08:36 PM    <DIR>          deepmedic
04/11/2020  11:56 AM            10,670 deepMedicRun
04/11/2020  11:56 AM    <DIR>          documentation
04/11/2020  06:12 PM    <DIR>          examples
04/11/2020  11:56 AM             1,493 LICENSE.txt
04/11/2020  11:56 AM               231 MANIFEST.in
04/14/2020  09:45 PM    <DIR>          MR_BRAIN
04/11/2020  11:56 AM            42,152 plotTrainingProgress.py
04/11/2020  11:56 AM                23 README.md
04/11/2020  11:56 AM                40 setup.cfg
04/11/2020  11:56 AM             1,407 setup.py
04/14/2020  09:20 PM           356,394 test.dcm
04/14/2020  09:20 PM             2,789 testDicom.py
              11 File(s)        417,870 bytes
               7 Dir(s)  18,907,107,328 bytes free

вывод ls в моем Ubuntu bash 

COPYRIGHT.md  LICENSE.txt  MANIFEST.in  README.md  deepMedicRun  deepmedic  documentation  examples  plotTrainingProgress.py  setup.cfg  setup.py  testDicom.py

Файл test.dm c

...