У меня есть куча автоматически отсканированных слайдов с использованием сканера слайдов (Hamamatsu), который я могу экспортировать из программного обеспечения NDPview с различным увеличением. До сих пор я приближался к тому, где я получаю наилучшее разрешение для своего региона по интересам, и добавляю масштабную линейку на 1 мм (как 1000 мкм), используя встроенную опцию масштабной линейки в программном обеспечении просмотра NDP. Затем я экспортирую «представление» из NDPview в TIFF. Этот TIFF затем импортируется в ImageJ (Фиджи), где я устанавливаю масштаб, используя нарисованную мною шкалу. Это работало хорошо, но с более чем 500 изображениями сделать это немного сложно.
Поскольку TIFF импортирует в ImageJ с размерами в дюймах, я решил, что могу go в Image -> Properties и просто изменить единицу длины на гм. Чтобы проверить это, я выбрал область для измерения. Затем я сравнил это со своим старым методом ... и значения совершенно разные. Есть идеи почему? 1 - старый метод, 2 - новый метод.

Я удостоверился, что "убрал масштаб" в окне шкалы масштаба между каждым тестом. Размеры всего изображения тоже разные:
