Итак, у меня есть коллекция 3D-точек, полученных в качестве решения какой-то программы. Каждый представляет центр какого-то «атома». Там нет порядка для точек в файле, каждая координата может указывать на любой из атомов в решетке. Когда данные наносятся на график with points, кристаллическую структуру раствора очень легко увидеть при использовании терминала qt в gnuplot, поскольку пользователь может перетаскивать экран, чтобы получить трехмерную перспективу. Однако для любого изображения c нет никакого реального способа точно определить, где точки расположены друг относительно друга, поскольку все точки имеют одинаковый размер независимо от того, как далеко они должны быть.
Например, этот вывод довольно бесполезен: 
Есть ли способ заменить точки заштрихованными и масштабированными сферами? Предоставление нескольких точек зрения одного и того же сюжета не является желательным решением в моем случае.