Как вы используете ImageJ для измерения столбчатости ячеек? - PullRequest
0 голосов
/ 30 марта 2020

Итак, у меня есть файл .czi, который представляет собой изображение некоторых ячеек. Имеет несколько z-стеков. То, что я хочу сделать, это измерить их столбчатость, т. Е. Я хочу иметь возможность «преобразовать» это изображение так, чтобы вместо того, чтобы смотреть на клетки сверху, я мог смотреть на них с одной стороны (и, таким образом, посмотреть, их столбчатые или нет).

Я попробовал опцию reslice, но с окончательным изображением, которое он дает мне, мне очень трудно увидеть, когда заканчивается ячейка и когда начинается следующая.

Есть ли другой вариант, который я мог бы использовать? Или я могу выполнить какую-либо другую обработку для изображения с дублированием, чтобы оно было более четким?

Заранее спасибо.

1 Ответ

0 голосов
/ 30 марта 2020

Выберите Изображение> Стеки> Ортогональные виды (Ma c ярлык - cmd + shift + H), при этом представления YZ и XZ отображаются справа и снизу от представления XY. Используйте курсор, чтобы переместить желтые перекрестия в любую ячейку, которую вы хотите исследовать.

...