pd_m <- pd(m,tree,include.root = T)
Fehler in extract.clade(.data, x) : node number must be greater than the number of tips
Show in New WindowClear OutputExpand/Collapse Output
Fehler in rep(NA, nEdges) : invalid 'times' Argument
2.
node.age(sub.tree)
1.
pd(m, tree, include.root = T)
pd () - это функция пакета picante, которая вычисляет меру альфа-разнесения. m - это образец, а tree - это дерево, которое необходимо для вычисления. is.rooted(tree) дал мне TRUE.
pd(m, tree, include.root = F)
all tips of the tree: returning NULLdrop
Что-то не так с узлами? m содержит отрицательные значения, но не содержит NA.