Я пытаюсь отфильтровать выборки в объекте DGEList, созданном в edgeR с помощью атрибута, который я назвал «архитектурой».
$ samples выглядит следующим образом:
$samples
group lib.size norm.factors architecture
15-AM_p_ap 1 36252192 1 p
15-LM-11_p_mi 1 34394164 1 p
15-LM-14_p_mi 1 37147178 1 p
15-LM-19_p_up 1 39236017 1 p
15-LM-2_p_lo 1 36543297 1 p
68 more rows ...
Я хочу установить подмножество Из списка исключить образцы с обозначением архитектуры "w". Я перепробовал больше вещей, чем помню, последнее из них:
y.subset <- y[which(!y$samples$architecture == "w"),]
Как мне сделать sh это?
Спасибо!