Я пытаюсь настроить эталонный геном на STAR 2.7.3a, чтобы я мог отобразить на него показания из моего RNA-Seq.
Вот код, который я использую:
STAR --runThreadN 4--runMode genomeGenerate--genomeDir /media/bigData/Valentin/Software/referenceGenomeforSTAR--genomeDir /media/bigData/Valentin/ReferenceGenome--genomeFastaFiles /media/bigData/Valentin/ReferenceGenome/Homo_sapiens.GRCh38.ncrna.fa /media/bigData/Valentin/ReferenceGenome/Homo_sapiens.GRCh38.dna.primary_assembly.fa--sjdbGTFfile /media/bigData/Valentin/ReferenceGenome--sjbdOverhang 100
EXITING из-за фатального ввода
ERROR: не удалось открыть readFilesIn = Read1
Jan 24 15:44:39 ...... FATAL ERROR, выход из
Кто-нибудь знает, что означает readFilesIn = Read1?
Спасибо