NIfTi vs DICOM для объемных данных 3D c - PullRequest
0 голосов
/ 21 января 2020

Существуют ли основные преимущества выбора NIfTi перед DICOM (или наоборот) в качестве выбора формата данных? Я работаю над трехмерной сегментацией c semanti c. Мне придется преобразовать либо формат в массив numpy, либо в тензор перед передачей в сеть, но любопытно, какие преимущества дает выбор производительности.

1 Ответ

1 голос
/ 21 января 2020

(Этот вопрос может быть основан на мнении, поэтому старайтесь придерживаться фактов.)

DICOM - это очень мощный, гибкий, но сложный формат, и его сила заключается в обеспечении взаимодействия между различными аппаратными и программными средствами. Однако DICOM не особенно эффективен для обработки и анализа изображений . Одним потенциальным недостатком DICOM является то, что один том хранится в виде последовательности 2D-срезов, с которыми может быть сложно работать.

NIfTi - улучшенная версия формата файла Analyze, которая была разработана для упрощения чем DICOM, сохраняя при этом все необходимые метаданные. И у него есть дополнительное преимущество - возможность хранить том в одном файле с простым заголовком, за которым следуют необработанные данные. Это ускоряет загрузку и обработку.

Существует несколько других форматов медицинских файлов , подходящих для этой задачи. Вы можете также sh рассмотреть NRRD , который имеет много общих черт с NIfTi. Простой формат, быстрый анализ и загрузка, гибкое кодирование для хранения данных 2,3,4D. Многие инструменты и библиотеки также могут обрабатывать файлы NRRD.

Таким образом, учитывая вашу первичную потребность в эффективном хранении и анализе, NIfTi или NRRD будет лучшим выбором.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...