К сожалению, не в данный момент. mlflow run запускает новый процесс, и сейчас нет протокола для исключения. В общем, другой проект даже не должен быть на том же языке.
Один из обходных путей, который я могу придумать, - передать исключение через mlflow, установив тег run. Например:
try:
...
except Exception as ex:
mlflow.set_tag("exception", str(ex))