Я пытаюсь сравнить два небольших набора данных Elasmobranchs, полученных при кустарном промысле в Бразилии, по кривым разрежения, основанным на единицах выборки, а не на численности. Поэтому я создаю фрейм данных с данными о наличии / отсутствии, в котором каждый столбец является единицей выборки, а каждая строка - видом (см. Здесь: https://textuploader.com/14dvs). Тем не менее, я постоянно получаю ошибки от R и думаю, что это связано с форматом загружаемых данных. Тем не менее, я был подтвержден другими исследователями, которые уже работали таким же образом и все еще были в состоянии дать результаты. Я был бы признателен, если бы кто-то, возможно, посмотрел на мои данные и попытался помочь мне выяснить, где я ошибаюсь!
Я использовал следующий код:
### Rarefaction with iNEXT -> Species X Visits
out <- iNEXT(Rarefaction_Visits, q=0, datatype="incidence_raw",
endpoint=NULL, size=NULL, knots=200, se=TRUE, conf=0.95, nboot=200)
### Sample-size-based R/E curves, separating plots by "order"
ggiNEXT(out, type=1, facet.var="order")
Спасибо и оставаться в безопасности!
Ps: В связанном txt-файле пока есть только один набор данных, но его должно быть достаточно для иллюстрации. Если нет, дайте мне знать.