ModuleNotFoundError при запуске paga со scanpy - PullRequest
2 голосов
/ 24 января 2020

Я попытался запустить код ниже, используя библиотеку scanpy, но по какой-то причине он сообщает об ошибке

ModuleNotFoundError: No module named 'igraph'
import numpy as np
import scanpy as sc 
import anndata

adata = anndata.AnnData(np.random.rand(300,300))
sc.tl.pca(adata, n_comps=30)
sc.pp.neighbors(adata, n_neighbors=16)
sc.tl.diffmap(adata, n_comps=50)
sc.tl.louvain(adata, resolution=1)
sc.pl.paga(adata)

1 Ответ

1 голос
/ 28 января 2020

Вам просто нужно запустить библиотеку установки igraph с помощью команды

pip install python-igraph
...