Невозможно установить Scanpy с - PullRequest
Новая
       35

Невозможно установить Scanpy с

2 голосов
/ 28 января 2020

Привет, у меня проблемы с установкой библиотеки Scanpy с помощью pip. Вот команда, которую я выполнил 

pip install scanpy

Во время установки выдает следующее сообщение об ошибке: 

Collecting scanpy
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/78/cf/b2cc01e9c33613d738c1cdeb5af7d250cf965bda187aa258e45ed25a6a15/scanpy-1.3.1.tar.gz (216kB)
     |████████████████████████████████| 225kB 786kB/s 
    ERROR: Command errored out with exit status 1:
     command: /home/john/Desktop/env2/bin/python2 -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'/tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/setup.py'"'"'; __file__='"'"'/tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' egg_info --egg-base /tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/pip-egg-info
         cwd: /tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/
    Complete output (5 lines):
    Traceback (most recent call last):
      File "<string>", line 1, in <module>
      File "/tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/setup.py", line 2, in <module>
        from pathlib import Path
    ImportError: No module named pathlib
    ----------------------------------------
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

Ответы [ 2 ]

3 голосов
/ 28 января 2020

Я думаю, что вы, возможно, запустили установку, используя python 2, которая устарела с начала 2020 года. Вы пробовали запустить установку для python 3, используя вместо этого команду pip3? 

pip3 install scanpy
1 голос
/ 28 января 2020

Попробуйте запустить команду еще раз с pip3. Если это не сработает, то вам нужно убедиться, что у вас установлена ​​Python 3 и используется соответствующая версия Pip. Этот превосходный ответ содержит подробные объяснения того, как go об обновлении, если у вас возникли трудности.

...