Как нарисовать химическую структуру в формате usking Rdkit? - PullRequest
0 голосов
/ 01 мая 2020

Я использую Rdkit для генерации химической структуры из Smiles.

     test = vectorizer.transform([i])
      cosine_similarities = cosine_similarity(test, X).flatten()
      similarity = cosine_similarities.argsort()[:-6:-1]
      for sim in similarity:
        print("Molecule")
        p=reactants[sim]
        q=p.replace(">",".")
        m = Chem.MolFromSmiles(p)
        fig1 = Draw.MolToMPL(m)

в этом коде l oop во время выполнения ломается.

Это не вывод на печать, как хотелось бы

Сначала печатаются все строки, а затем структура Это изображение показывает, как генерируется изображение структуры

...