Я хочу использовать hivmmer для генотипирования ВИЧ, но я не могу понять, каким должен быть файл эталонного генома. Я попытался использовать обычный файл fasta HXB2, но он выдает следующую ошибку:
Ошибка: проблема с форматом файла при попытке открыть файл HMM ./Reference.fa. Тег формата '{\ rtf1 \ ansi \ ansicpg1252 \ cocoartf2511' ': не распознан. Текущий формат H3 - «HMMER3 / f». Предыдущие форматы H2 / H3 als
Должно ли это быть pHMM? Если да, то как мне создать такую ссылку или ее можно скачать? Я был бы очень признателен, если бы кто-нибудь помог мне разобраться в этом.