Вы должны проверить, как вы наклеиваете стикеры на свое видео. Это анимация (изображения движения стикера) или просто изображение. Если это всего лишь одно изображение, например, перед началом сеанса экспорта вы можете сделать что-то вроде этого:
let parentLayer = CALayer()
let videoLayer = CALayer()
let overlayLayer = CALayer()
let stickerLayer = CALayer()
parentLayer.frame = CGRect(origin: .zero, size: renderSize)
videoLayer.frame = parentLayer.frame
stickerLayer.frame = parentLayer.frame
overlayLayer.frame = parentLayer.bounds
//Add the image inside of stickerLayer(in this case its from a screen shot of UIView, you can change to your custom UIImage
stickerLayer.contents = self.stickerView.asImage().cgImage
parentLayer.addSublayer(videoLayer)
parentLayer.addSublayer(stickerLayer)
parentLayer.addSublayer(overlayLayer)
//create composition
let videoComposition = AVMutableVideoComposition()
videoComposition.renderSize = CGSize(width: renderSize.width, height: renderSize.height)
videoComposition.frameDuration = CMTimeMake(value: 1, timescale: 30)
videoComposition.renderScale = 1.0
//finally add layers with animationTool
videoComposition.animationTool = AVVideoCompositionCoreAnimationTool(postProcessingAsVideoLayers: [videoLayer], in: parentLayer)