Я использовал plot_glass_brain для визуализации трехмерного изображения (Nifti) с помощью nilearn, но оно отображается некорректно. см. код и изображения ниже
Файл 2_1_t2.nii доступен по этой ссылке: https://drive.google.com/file/d/1_gsg8sO9c7Ws6Xd7xB1uFSW8H31tAHtm/view?usp=sharing
import matplotlib.pyplot as plt
from nilearn.plotting import plot_anat, show
plotting.plot_glass_brain('2_1_t2.nii')
plotting.show()