Перенос кода Tensorflow 1.x в Tensorflow 2.x с использованием класса модели Keras - PullRequest
1 голос
/ 26 мая 2020

Я только начал изучать Tensorflow 2.1.0 с Keras 2.3.1 и Python 3.7.7.

Я нашел это « Классификация набора символов Omniglot с использованием прототипной сети"github Jupyter Notebook, который, я думаю, работает с Tensorflow 1.x.

Моя проблема связана с этим фрагментом кода:

for epoch in range(num_epochs):

    for episode in range(num_episodes):

        # select 60 classes
        episodic_classes = np.random.permutation(no_of_classes)[:num_way]

        support = np.zeros([num_way, num_shot, img_height, img_width], dtype=np.float32)

        query = np.zeros([num_way, num_query, img_height, img_width], dtype=np.float32)


        for index, class_ in enumerate(episodic_classes):
            selected = np.random.permutation(num_examples)[:num_shot + num_query]
            support[index] = train_dataset[class_, selected[:num_shot]]

            # 5 querypoints per classs
            query[index] = train_dataset[class_, selected[num_shot:]]

        support = np.expand_dims(support, axis=-1)
        query = np.expand_dims(query, axis=-1)
        labels = np.tile(np.arange(num_way)[:, np.newaxis], (1, num_query)).astype(np.uint8)
        _, loss_, accuracy_ = sess.run([train, loss, accuracy], feed_dict={support_set: support, query_set: query, y:labels})

        if (episode+1) % 10 == 0:
            print('Epoch {} : Episode {} : Loss: {}, Accuracy: {}'.format(epoch+1, episode+1, loss_, accuracy_))

Есть ли какой-нибудь учебник, книга или статья для помогите мне перенести этот код на Tensorflow 2.x и Keras, используя модель Keras?

Я хочу написать код из ссылки примерно как этот:

import numpy as np 
import os
import skimage.io as io
import skimage.transform as trans
import numpy as np
from keras.models import *
from keras.layers import *
from keras.optimizers import *
from keras.callbacks import ModelCheckpoint, LearningRateScheduler
from keras import backend as keras

def unet(pretrained_weights = None,input_size = (256,256,1)):
    inputs = Input(input_size)
    conv1 = Conv2D(64, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(inputs)
    conv1 = Conv2D(64, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv1)
    pool1 = MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(conv1)
    conv2 = Conv2D(128, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(pool1)
    conv2 = Conv2D(128, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv2)
    pool2 = MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(conv2)
    conv3 = Conv2D(256, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(pool2)
    conv3 = Conv2D(256, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv3)
    pool3 = MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(conv3)
    conv4 = Conv2D(512, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(pool3)
    conv4 = Conv2D(512, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv4)
    drop4 = Dropout(0.5)(conv4)
    pool4 = MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(drop4)

    conv5 = Conv2D(1024, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(pool4)
    conv5 = Conv2D(1024, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv5)
    drop5 = Dropout(0.5)(conv5)

    up6 = Conv2D(512, 2, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(UpSampling2D(size = (2,2))(drop5))
    merge6 = concatenate([drop4,up6], axis = 3)
    conv6 = Conv2D(512, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(merge6)
    conv6 = Conv2D(512, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv6)

    up7 = Conv2D(256, 2, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(UpSampling2D(size = (2,2))(conv6))
    merge7 = concatenate([conv3,up7], axis = 3)
    conv7 = Conv2D(256, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(merge7)
    conv7 = Conv2D(256, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv7)

    up8 = Conv2D(128, 2, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(UpSampling2D(size = (2,2))(conv7))
    merge8 = concatenate([conv2,up8], axis = 3)
    conv8 = Conv2D(128, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(merge8)
    conv8 = Conv2D(128, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv8)

    up9 = Conv2D(64, 2, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(UpSampling2D(size = (2,2))(conv8))
    merge9 = concatenate([conv1,up9], axis = 3)
    conv9 = Conv2D(64, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(merge9)
    conv9 = Conv2D(64, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv9)
    conv9 = Conv2D(2, 3, activation = 'relu', padding = 'same', kernel_initializer = 'he_normal')(conv9)
    conv10 = Conv2D(1, 1, activation = 'sigmoid')(conv9)

    model = Model(input = inputs, output = conv10)

    model.compile(optimizer = Adam(lr = 1e-4), loss = 'binary_crossentropy', metrics = ['accuracy'])

    #model.summary()

    if(pretrained_weights):
        model.load_weights(pretrained_weights)

    return model

и в train.py:

model = unet(...)
model.compile(...)
model.fit(...)

1 Ответ

1 голос
/ 26 мая 2020

Существует этот учебник от Tensorflow dow, который суммирует все.

Самое главное, что Sessions больше не существует, и модель должна быть создана с использованием tensorflow.keras.layers.

Теперь при обучении модели у вас есть 2 варианта: либо вы используете метод Keras, либо вы можете использовать GradientTape (что вроде старого способа).

Это означает, что вы есть два варианта: один, который не будет иметь большого значения в вашем коде (GradientTape), другой, который заставит вас изменить несколько вещей (Keras).

Gradient Tape

GradientTape используется, когда вы хотите создать свой собственный l oop и вычислить градиент, как вы хотите, это похоже на Tensorflow 1.X.

  • Создайте свою модель с помощью Keras API:
import tensorflow as tf

def unet(...):
    inputs = tf.keras.layers.Input(shape_images)
    ...
    model = Model(input = inputs, output = conv10)

    model.compile(...)

    return model

...

model = unet(...)
  • Определить потерю
mse = tf.keras.losses.MeanSquaredError()
  • Определить оптимизатор
optimizer = tf.keras.optimizer.Adam(lr=1e-4)

Затем вы проводите обучение, как обычно, за исключением что вы заменили старый механизм сеанса на GradientTape:


for epoch in range(num_epochs):

    for episode in range(num_episodes):

        # select 60 classes
        episodic_classes = np.random.permutation(no_of_classes)[:num_way]

        support = np.zeros([num_way, num_shot, img_height, img_width], dtype=np.float32)

        query = np.zeros([num_way, num_query, img_height, img_width], dtype=np.float32)


        for index, class_ in enumerate(episodic_classes):
            selected = np.random.permutation(num_examples)[:num_shot + num_query]
            support[index] = train_dataset[class_, selected[:num_shot]]

            # 5 querypoints per classs
            query[index] = train_dataset[class_, selected[num_shot:]]

        support = np.expand_dims(support, axis=-1)
        query = np.expand_dims(query, axis=-1)
        labels = np.tile(np.arange(num_way)[:, np.newaxis], (1, num_query)).astype(np.uint8)

        # No session here but a Gradient computing

        with tf.GradientTape() as tape:
            prediction = model(support) # or whatever you need as input of model
            loss = mse(label, prediction)
        # apply gradient descent
        grads = tape.gradient(loss, model.trainable_weights)
        optimizer.apply_gradients(zip(grads, model.trainable_weights))

Keras

* 1 037 * Для keras вам нужно изменить способ подачи данных, у вас не будет for l oop, поскольку вы используете fit, тогда как вам нужно реализовать Generator или любую другую структуру данных которые можно повторить. Это означает, что вам в основном нужен список (X, y). data_struct [0] предоставит вам первую пару X, Y.

Если у вас есть эта структура данных, это просто.

  • Определите модель так же, как GradientTape

  • Определите оптимизатор так же, как GradientTape

  • Скомпилируйте модель


model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer=optimizer, metrics=['accuracy']) # Or whatever you need as loss/metrics

  • Установите модель используя вашу data_struct
model.fit(data_struct, epochs=500) # Add validation_data if you want, callback ...
...