Я пытаюсь создать основные данные для анализа взаимодействия белков, где я использую базу данных STRING из R и внешний набор данных, присутствующий в excel (https://drive.google.com/file/d/1aJisbhWyqUFcx_wIBMxcDtw5fMIE-z5d/view?usp=sharing)
Я бы очень благодарю за помощь в идеях / кодах, которые можно использовать в таких случаях.
Ниже приведен код, на который я пытался ответить:
install.packages("BiocManager")
install.packages("STRINGdb")
library(BiocManager)
library("STRINGdb")
string_db <- STRINGdb$new( version="11", species=469008, score_threshold=00, input_directory="")
library(readxl)
p <- read_excel("1.xlsx")
View(p)
p_mapped <- string_db$map( p, "gene", removeUnmappedRows = TRUE )
**Error in tempMatr[i, ] : incorrect number of dimensions**