Я использую DEseq2 для анализа DE и хочу проанализировать опубликованный набор данных. Однако представленная матрица подсчета показывает не идентификаторы генов ENSEMBL, а идентификаторы транскриптов мРНК, т.е. первый столбец выглядит так: XM_0176201594.2
Может ли кто-нибудь сказать мне, как преобразовать или получить из GTF, чтобы получить обычная матрица подсчета, которая служит входом для DESeq2? По сути, мы смотрим на матрицу, где несколько строк соответствуют одному гену, верно?
Заранее спасибо!