Не отображается тепловая карта категориальных данных Bokeh - PullRequest
Новая
       21

Не отображается тепловая карта категориальных данных Bokeh

0 голосов
/ 06 августа 2020

Я пытаюсь создать тепловую карту из CSV, используя python pandas. Я продолжаю получать пустой экран для вывода, и я не знаю почему - я исчерпал всю документацию в Интернете, чтобы попытаться понять это. Мой код выглядит следующим образом: 

import numpy as np
from bokeh.io import output_file, show
from bokeh.models import (
    ColumnDataSource,
    HoverTool,
    LinearColorMapper,
    BasicTicker,
    PrintfTickFormatter,
    ColorBar,
    FactorRange
)
from bokeh.plotting import figure
from bokeh.sampledata.unemployment1948 import data
from bokeh.transform import transform

#Initialize DataFrame
df = pd.read_csv("myData.csv") 

df.dropna().astype(float)
df.columns.name = 'Month'
df.index.name = 'Facility'

df_1 = pd.DataFrame(df.stack(), columns=['state']).reset_index()
source = ColumnDataSource(df_1)  


#Heatmap
colors = ["#75968f", "#a5bab7", "#c9d9d3", "#e2e2e2", "#dfccce", "#ddb7b1", "#cc7878", "#933b41", "#550b1d"]
mapper = LinearColorMapper(palette=colors, low=df_1.state.min(), high=df_1.state.max())

TOOLS = "hover,save,pan,box_zoom,reset,wheel_zoom"

p = figure(title="WSSDM4",
           x_range= list(df.columns), y_range=list(df.index),
           x_axis_location="above", plot_width=1800, plot_height=800,
           tools= TOOLS, toolbar_location='below',
           tooltips=[('Facility', '@Facility'), ('Month', '@Month')])

p.rect(x='Facility', y = 'Month',width=1, height=1, source=source,
        line_color=None, fill_color=transform('state', mapper))
   
color_bar = ColorBar(color_mapper=mapper, major_label_text_font_size="7px",
                     ticker=BasicTicker(desired_num_ticks=len(colors)),
                     label_standoff=6, border_line_color=None, location=(0, 0))

p.add_layout(color_bar, 'right')

p.axis.axis_line_color = None
p.axis.major_tick_line_color = None
p.axis.major_label_text_font_size = "7px"
p.axis.major_label_standoff = 0
p.xaxis.major_label_orientation = 1.0
show(p)

Я использую ноутбуки Jupyter и имею все современные библиотеки.

Спасибо!

1 Ответ

0 голосов
/ 06 августа 2020

Я считаю, что ваша проблема в этой строке: df.index.name = 'Facility'

Все, что это будет делать, это назвать существующий индекс df (который выглядит как 0, 1, 2, 3 ...) "Facility", а чем взять существующий столбец Facility и сделать его индексом. Для этого вам нужно: df = df.set_index('Facility')

Я обнаружил это несоответствие, добавив кучу операторов print(df.head()) после каждой строки, в которой ваш код изменил набор данных, и проделав то же самое в исходной тепловой карте Bokeh. пример и ищем где они разошлись. Может быть полезно в случае других проблем.

...