Краткий ответ "нет".
К тому времени, когда ваш .emacs прочитан, был сделан выбор, использовать ли графическое или неграфическое отображение.
Возможно, псевдоним оболочки будет лучше соответствовать вашим потребностям
alias emacs 'emacs -nw'
Вы можете проверить это, добавив
(y-or-n-p "Sourcing .emacs...")
в верхней части вашего .emacs и запускайте как графические, так и не графические варианты Emacs, в любом случае, когда вы получите приглашение после появления Emacs (графически или не графически).