Я не знаю ни одной опции javadoc, которая выдаст предупреждение о недокументированных элементах.
Однако, если вы используете Eclipse, взгляните на настройки в
Окно -> Настройки -> Java -> Компилятор -> Javadoc
Там вы можете указать Eclipse выдавать предупреждения на недокументированные элементы.