Apple внесла много изменений в экран создания файлов Xcode, и они также застали меня врасплох. Я не совсем уверен, что ваш контроллер навигации пытается выполнить, но этот пост на форуме iPhoneDevSDK объясняет, почему вы не должны создавать подкласс UINavigationController и вместо этого представлять свое представление модально.
iPhoneSDK Forum UINavigation Контроллер подклассов
В дополнение к обсуждению на форуме о контроллерах модального представления, здесь приведен исходный код из руководства по программированию Apple View Controller, в котором объясняется, как этого добиться.
YourViewController *viewController = [[YourViewController alloc] initWithNibName:@"YourView" bundle:nil];
viewController.delegate = self;
UINavigationController *navigationController = [[UINavigationController alloc] initWithRootViewController:viewController];
[self presentModalViewController:navigationController animated:YES];