Лучший способ, наверное, просто общение и образование. Проводите групповые встречи - убедитесь, что все ваши разработчики находятся на одной странице. У нас похожая структура SVN, и всякий раз, когда я исправляю ошибку, первое, что я задаю себе после фиксации, это «где еще это нужно объединять? - это просто врезалось в мой разум через общение и повторение.
Разместите список веток, получающих объединенные ошибки, на вики-странице или другом общедоступном документе, чтобы его могли легко найти все разработчики.