Новые файлы и папки ниже папки, из которой вы запускали скрипт, автоматически будут использовать то же свойство BugzID. Так что, это должно сработать.
Если вы создаете новую папку, которая не является подпапкой исходной папки, вам придется запустить сценарий и для этой папки.
Вот выдержка из ссылки:
«Черепаха будет искать путь к вашей папке на извлечении, ища это свойство, поэтому, если вы извлекаете из других папок в своем дереве, обязательно проделайте ту же процедуру для этих папок».