Проще говоря, я бы предположил, что, поскольку ваша бизнес-модель - это электронная коммерция, вам требуется согласованность транзакций в вашем решении для обработки данных. По этой причине вам следует выбрать один из параметров RDS (это MySQL, Oracle или SQL Server).
AWS SimpleDB - это нереляционное хранилище данных (или NoSQL), поэтому вы получаете гибкость (т.е. отсутствие схемы или упрощение схемы) и масштабируемость, но вы не получаете немедленной (транзакционной) согласованности и также шаблон запроса не будет использовать соединения.