Я не очень много использовал pydev, , но IIRC вы можете изменить, какой интерактивный переводчик вы используете.Если это возможно, установите ipython и используйте его в режиме pylab (ipython --pylab из командной строки)
Оказывается, вы не можете изменить интерпретатор.Вы можете запускать команды интерпретатора, поэтому, возможно, можно запустить оболочку ipython таким образом, но было бы проще просто запустить ipython --pylab
из терминала и запустить его параллельно с сеансом затмения.
HTH