С Tfs у меня был намного лучший опыт слияния от ветви к стволу , и я думаю, что это может быть здесь. Конечно, это может потребовать переосмысления вашей стратегии, но это выполнимо.
Я знаю, что это может быть в офсайде, но если вы делаете многоотраслевое слияние, тогда определенно рассмотрите распределенную систему контроля версий, такую как mercurial . Я много использовал Tfs, и мне действительно это нравится, но когда дело доходит до ветвления и слияния, это всего лишь отдаленная секунда до hg merge (команда mercurial)