Это может быть довольно сложно, потому что afaik tfs не поддерживает то, что иногда называют "cherrypicking", то есть объединение нескольких иначе связанных наборов изменений в ветку. Tfs ожидает, что вы объедините всю ветку до определенной версии, не оставляя никаких изменений. Боюсь, то, что вы спрашиваете, невозможно напрямую.
Вы можете сделать это вручную, но для большого количества наборов изменений это будет болезненно. Вкладка «ссылки» в рабочем элементе содержит все идентификаторы наборов изменений, которые были связаны с рабочим элементом - это может вам помочь.