Я немного отстаю от того, где вы находитесь в данный момент - я написал одно простое приложение на основе phonegap, используя jquery / jspec / phonegap, и, похоже, оно работает довольно хорошо ... но я только протестировал его на iphone 4 simulator (еще не зарегистрировался в программе разработчика Apple). Любопытно посмотреть, где вы получите с этим.
Я слышал (от прямого конкурента, так что возьмите его с крошкой соли), что jQuery может быть «медленным» на iphone - может быть, xUI - правильный путь? http://xuijs.com/
Я придерживаюсь JQuery, пока я не знаю.
Я предполагаю, что вы используете 'min.js' в ваших финальных выпусках?