Мне не известно ни о каком "правильном" решении, но я могу вам сказать, что у вас не должно возникнуть проблем, если вы просто скопируете boost/numeric/odeint.hpp
и boost/numeric/odeint/*.hpp
в этот каталог, поскольку ни один файл не будет перезаписан (если что-то не получится просто удалите их, и все готово).
Для чего это стоило, я сделал это для boost :: process, и все заработало без проблем.