Вы проверили, чтобы убедиться, что в свойствах файлов .resx для параметра "Копировать в каталог вывода" установлено значение Копировать всегда ?
ОБНОВЛЕНИЕ: Я прошу прощения за то, что не прочитал ваш вопрос достаточно внимательно.
По этой ссылке http://msdn.microsoft.com/en-us/library/dd434211.aspx, необходимо проверить раскрывающийся список Items to Deploy и убедиться, что у вас установлен один из следующих двух параметров:
Все файлы в этом проекте. Все файлы, включенные в проект, развернуты на конечном сервере.Файлы, которые находятся в папке проекта, но не включены в проект, исключаются.
или
Все файлы в этой папке проекта. Все файлы в папке проектаразвернут на сервере назначения, даже если они исключены из проекта.