Как экспортировать пиксельные координаты точечных объектов из изображения (с изображением j?)

Question

Я занимаюсь проектом, в котором меня интересует расстояние и распределение точечных объектов на изображении с микроскопа.

Таким образом, изображение состоит из более темных круглых маленьких точек на довольно сложном фоне.Было бы неплохо сделать это с помощью сценария извлечения функций автоматически, но сейчас я просто выбираю точки вручную ... Потому что я доверяю своим глазам:)

Я просмотрел несколько разныхПрограммное обеспечение и до сих пор мне понравился imagej, который имеет функцию многоточечного выбора.Но я не мог понять после выбора точек вручную, как экспортировать координаты.Все, что мне нужно, это X и Y для каждой точки (около ста точек для каждого изображения).

Любые указатели?

Или, если у вас есть альтернативные идеи о том, как это сделать, предложитемне другую программу (matlab?), или даже указать мне на другие полезные чтения и т.д ...

Спасибо огромное!

Answer 1

Хотя это не тот процесс, к которому вы стремитесь, в ImageJ написано нечто похожее для анализа 'Dot Blots'

http://image.bio.methods.free.fr/dotblot.html

У него есть номерметодов для определения точек, а также может экспортировать результаты в виде CSV.Сам код доступен в нижней части вышеупомянутой страницы, поэтому вы сможете работать с ним, если вы заинтересованы в автоматизации.

Answer 2

OK. С некоторой помощью я обнаружил, что могу сделать это с помощью CTRL-M в imagej ...