UMFPACK и UBLAS разреженная матрица BOOST - PullRequest
Новая
       46

UMFPACK и UBLAS разреженная матрица BOOST

4 голосов
/ 21 октября 2010

Я использую uBLAS Boost в числовом коде, и у меня есть «тяжелый» решатель:

http://www.crystalclearsoftware.com/cgi-bin/boost_wiki/wiki.pl?LU_Matrix_Inversion

Код работает превосходно, однако он очень медленныйПосле некоторых исследований я обнаружил UMFPACK , который является разреженным матричным решателем (среди прочего).Мой код генерирует большие разреженные матрицы, которые мне нужно очень часто инвертировать (правильнее решать, значение обратной матрицы не имеет значения), поэтому класс UMFPACk и BOOST Sparse_Matrix кажется счастливым браком.

UMFPACK запрашивает разреженную матрицу, указанную тремя векторами: счетчик записей, индексы строк и записи.( См. Пример ).

Мой вопрос сводится к тому, могу ли я получить эти три вектора эффективно из класса BARST Sparse Matrix?

1 Ответ

6 голосов
/ 21 октября 2010

Для этого есть привязка:

http://mathema.tician.de/software/boost-numeric-bindings

Кажется, что проект стоит два года, но он хорошо справляется со своей задачей. Пример использования: 

    #include <iostream>
    #include <boost/numeric/bindings/traits/ublas_vector.hpp>
    #include <boost/numeric/bindings/traits/ublas_sparse.hpp>
    #include <boost/numeric/bindings/umfpack/umfpack.hpp>
    #include <boost/numeric/ublas/io.hpp>

    namespace ublas = boost::numeric::ublas;
    namespace umf = boost::numeric::bindings::umfpack;

    int main() {

      ublas::compressed_matrix<double, ublas::column_major, 0,
       ublas::unbounded_array<int>, ublas::unbounded_array<double> > A (5,5,12); 
      ublas::vector<double> B (5), X (5);

      A(0,0) = 2.; A(0,1) = 3; 
      A(1,0) = 3.; A(1,2) = 4.; A(1,4) = 6;
      A(2,1) = -1.; A(2,2) = -3.; A(2,3) = 2.;
      A(3,2) = 1.;
      A(4,1) = 4.; A(4,2) = 2.; A(4,4) = 1.; 

      B(0) = 8.; B(1) = 45.; B(2) = -3.; B(3) = 3.; B(4) = 19.; 

      umf::symbolic_type<double> Symbolic;
      umf::numeric_type<double> Numeric;

      umf::symbolic (A, Symbolic); 
      umf::numeric (A, Symbolic, Numeric); 
      umf::solve (A, X, B, Numeric);   

      std::cout << X << std::endl;  // output: [5](1,2,3,4,5)
    }

Примечание

Хотя эта работа, я подумываю о переходе на NETLIB

...