Вы отметили вопрос RC, поэтому я предполагаю, что это не Selenium IDE.
Вы можете использовать что-то вроде selenium.selectWindow или selenium.selectPopUp или selenium.windowFocus для нацеливания на новое окно.
Техника, которую я нахожу весьма полезной, состоит в том, чтобы использовать Selenium IDE для захвата сценария, а затем выбрать «Параметры», а затем требуемый формат программирования (Java, C # и т. Д.), А затем использовать этот фрагмент в качестве основы теста RC.