перейдите в настройки-> Pydev-> Интерпретатор - Python и нажмите кнопку «Применить». Это отсканирует каталог ваших модулей и добавит недостающие модули.
Это должно исправить любые обычные ошибки импорта. Некоторые модули совершают магию во время выполнения, которой PyDev не может следовать.