Файл экспортируется правильно, но файл HTML содержит iframe, поэтому часть iframe не экспортируется в doc и excel. iframe вызывает HTML-файл для графа. График выполнен с использованием flex.
Взгляните на библиотеки PHPExcel и PHPWord .Это библиотеки PHP, которые позволят вам создавать настоящие файлы MS Excel и / или MS Word.