Нет / Не совсем.
Прежде всего, версия для iphone использует Objective-C, а версия для Android использует Java в качестве основного языка программирования.Это делает их несовместимыми с языковой точки зрения.
Что касается функций и стабильности, cocos2d - движущаяся цель, и сборка андроида, как и любого другого движка cocos2d, значительно отстает от cocos2d-iphone.Возможно, за исключением cocos2d-x, разработчики которого стараются быть как можно ближе к cocos2d-iphone по функциональности.