Мой вопрос связан с выравниванием последовательности белка. Когда я использую ClustalW для alignmnet, я вижу процент идентичности, сильно похожий и еженедельно похожий. Но я хочу найти процент сходства всех выровненных последовательностей, а не идентичность.
Я искал программное обеспечение, которое поможет найти алгоритмы для его решения, но я не могу загрузить их, например: MStatX звучит многообещающе для решения моей проблемы, но почему-то я не могу найти информацию для его загрузки.
Я даже читал о Матрице сходства, которая выглядит как одно решение для вычисления процентного сходства последовательности. Даже для этого я не знаю, где найти информацию для загрузки любого программного обеспечения, если таковое существует.
Может ли кто-нибудь помочь мне в поиске подходящего инструмента или метода для расчета процента сходства в нескольких выровненных последовательностях.
Спасибо,
pavithra.