В Windows Server можно включить групповую политику, которая будет записывать такую информацию, как доступ к файлам / папкам и их удаление. Вы должны были бы включить эту регистрацию аудита, когда папка была удалена, чтобы сообщить , когда она была удалена.
Вот сообщение в блоге, в котором объясняется, как настроить эту групповую политику аудита. http://sogeeky.blogspot.com/2006/07/how-to-audit-and-track-file-deletions.html
Вы, вероятно, получите лучший ответ на этот вопрос на Ошибка сервера .