Я действительно наткнулся на эту страницу после того, как столкнулся с той же проблемой, я отредактировал файл manifest.mf, но изменения не были показаны в файле jar MANIFEST.MF. Я нашел проблему, с которой столкнулся, и подумал, что передам информацию на всякий случай.
Что я делал неправильно, так это то, что у меня не было проекта, над которым я работал, в качестве основного проекта, поэтому, когда я редактировал правильный манифест, я компилировал неправильный проект.
Итак, я полагаю, что краткую историю вы проверили и проверили, правильно ли вы выбрали проект для файла manifest.mf, который вы редактируете?