Вам нужно будет упаковать ваше приложение в CAB-файл.
Сделать это довольно просто - вы просто создаете новый «CAB-проект Smart Device» (New Projet-> Другие типы проектов-> Настройка и развертывание).
Для начала - укажите, что вы хотите, чтобы выходные данные из exe-проекта вашего приложения помещались в каталог приложений вместе с любыми другими зависимыми библиотеками.
Вы также можете создать значок для своего приложения, щелкнув правой кнопкой мыши Файловая система на целевом компьютере, выбрав Добавить специальную папку-> Папка меню Пуск, затем снова щелкнув правой кнопкой мыши в Папке меню Пуск и выбрав Создать новый ярлык. Теперь наведите этот ярлык на исполняемый файл для вашего приложения.
В зависимости от требований вашего проекта, может быть также желательно создать настольный установщик (msi-файл), который ваши пользователи смогут запускать непосредственно на своем ПК с Windows, который инструктирует ActiveSync для автоматической установки вашего cab-файла, когда устройство Windows Mobile затем подключаем. В основном это делается путем вызова ActiveSync (CeAppMgr.exe) из командной строки и передачи ему INI-файла, ссылающегося на ваш CAB-файл.
Если вам нужно сделать что-то более сложное во время установки, также можно написать «настраиваемое действие», когда cab-файл обращается к другой dll (написанной вами), чтобы выполнить любые дополнительные шаги, которые должны произойти. во время установки.
Полное руководство по всему вышесказанному доступно здесь