Две вещи, пробелы не могут быть в rdf: ID, если они не экранированы, они должны в конечном итоге сформировать действительные URI.Кроме того, не похоже, что в этом файле есть определенная база XML, что также является проблемой.
Возможно, было бы лучше просто выполнить преобразование вручную, это очень простая онтология, и это не потребовало быВы долго воссоздаете его в Протеже.