Я закончил тем, что создал новый скрипт, который читает входные файлы и ищет специальные символы в их названии.
Это было действительно легко:
string filename = filename.Replace("©", "e");
Поскольку в имени файла содержится символ «©», скрипт (на C #) может его распознать и заменить соответствующим образом. Таким образом, я могу просматривать все папки и подпапки, просто читая имя файла и меняя специальные символы.
Спасибо всем за вклад!