Я только что переехал в Lion, и тот же проект был скомпилирован на Snow Leopard (и относительно предыдущей версии Xcode), и у меня не было такой проблемы.
Теперь каждый раз, когда я запускаю проект, он выполняет все с нуля (источники, ресурсы и прочее).
Учитывая, что мой проект имеет довольно большое количество ресурсов (большинство из них pngs), это займет вечность даже на моем Mac Pro конца 2010 года (что-то вроде 3/4 минуты на компиляцию).
Эта проблема заставляет меня тратить кучу времени.
Если бы кто-то уже сталкивался с этой проблемой в прошлом и нашел решение, я был бы ему очень благодарен.
Спасибо!