Установите свой HTML-код таким образом, чтобы wmode объекта Flash был "непрозрачным" (или прозрачным, если вам действительно нужно).Если вы не укажете его, он будет интерпретироваться как некоторый другой параметр по умолчанию, который дает вам это снижение производительности кадров.
Пример:
<object type="application/x-shockwave-flash" data=
"YourFlashMovie.swf" width="640" height="480"
id="flash_id_1" style="visibility: visible;">
<param name="allowScriptAccess" value="always" />
<param name="allowScale" value="never" />
<param name="allowFullScreen" value="true" />
<param name="wmode" value="opaque" /> <!-- THIS IS WHAT YOU MUST SET -->
<param name="quality" value="high" />
<param name="scale" value="" />
<param name="scaleMode" value="" />
<param name="menu" value="false" />
</object>
Надеюсь, что это поможет.