Я не уверен, что он поддерживает то, что вы ищете, без какого-либо взаимодействия с пользователем.
Что я делаю, это щелкаю правой кнопкой мыши на Project -> Subversion -> Show Changes.На открывшейся панели есть кнопка Обновить, которая сканирует svn.Это сработало для меня для последних нескольких версий, а также для разных версий SVN (1,6 против огромных 1,7 изменений).
Вы также можете посетить официальные форумы и посмотреть, сможете ли вы получить официальный ответ: forums.netbeans.org .
Обновление
Только что-то вспомнил.Вы используете SVN 1.6 или 1.7?Последнее, что я слышал, Netbeans изначально не поддерживает SVN 1.7.См. эту страницу для получения дополнительной информации.